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轉錄組數據與杜鵑屬植物的遺傳關係

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轉錄組數據與杜鵑屬植物的遺傳關係


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  • 轉錄組數據與杜鵑屬植物的遺傳關係

杜鵑花以其豔麗的花朵而聞名於世,鹿角杜鵑是一種適應性強、海拔範圍分布廣的杜鵑花,具有美麗的香花和藥用功效。然而,杜鵑花的遺傳研究一直受限於有限的基因組資源和遺傳標記。在這項研究中,杜鵑花轉錄組衍生出的80660個單基因組成一個龐大的數據庫。在這些單基因中,34867個單基因(43.22%)被注釋為公共蛋白質數據庫。此外,從16019個單基因序列中鑒定出14415個EST-SSR,平均每2.87 kb有一個SSR。其中雙核苷酸SSR很豐富(80.03%),其次是三核苷酸(18.82%)、四核苷酸(0.91%)、五核苷酸(0.13%)和六核苷酸(0.11%)。進一步研究,篩選出200對具有6個以上串聯重複序列的引物,其中58對引物擴增成功,顯示出6個杜鵑品種的多態性。在這58對引物中,37對引物在來37種杜鵑花和中國本土的兩大群體中的30個鹿角杜鵑個體中具有多態性。共鑒定出382個等位基因,平均每個位點10.3個等位基因。係統發育樹、遺傳結構分析和主成分分析表明,主要類群與已知的係統發育樹和地理分布相對應。這些轉錄組數據將有助於杜鵑的基因發掘和功能基因組研究,並且新開發的EST-SSR標記可應用於多種杜鵑屬植物中,並用於評價杜鵑屬植物的遺傳關係。


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