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組蛋白修飾影響基因的表達

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組蛋白修飾影響基因的表達


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  • 組蛋白修飾影響基因的表達

     眾所眾知,組蛋白修飾影響基因的表達。一些研究已經顯示,在非生物脅迫下在植物基因的表達主要是由組蛋白修飾所調控的。但是在全基因組範圍內探究脅迫相關的組蛋白修飾缺較少,農作物中的研究更是很少。在本次研究中,作者利用ChIP-seq和RNA-seq技術探究了在幹旱脅迫下水稻全基因組內H3K4me3的分布模式,並且研究了該模式相關的基因表達模式。在正條件和幹旱條件下,H3K4me3修飾分別關聯到了51.1%和48%的基因,RNA-seq結果顯示分別有76.7% 和79%的基因發生了表達。作者以一個量化的標準鑒定不同基因的H3K4me3水平,發現4837個基因H3K4me3水平發生了改變,其中3927個基因H3K4me3水平增加,910個基因H3K4me3水平降低。在幹旱脅迫下,5866個基因的表達發生差異,其中2145個基因上調表達3721個基因下調表達。將H3K4me3差異水平與基因表達水平相關聯分析,H3K4me3水平的差異僅僅影響了一小部分基因的表達差異。在這類基因中,一部分基因的H3K4me3水平差異與基因表達差異顯著正相關。除此之外,兩者呈負相關關係。總的來說,H3K4me3和基因表達水平的綜合分析為以後研究表觀遺傳調控植物對非生物逆境的響應有著重要的意義。

基因表達調控

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關鍵詞:表觀組學技術服務,基因表達定量,基因表達調控

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