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近日,來自日本一個研究小組開發出了一種新型技術,可以對大腦結構中的基因表達樣式進行三維成像,這種技術俗稱為轉錄組斷層技術,其結合了組織切片的微陣列技術,可以都對腦部基因表達的密度和位置進行精確圖譜成像,相比當前的繪圖成像技術,這種新型技術具有較高的分辨率,相關研究成果發表於國際雜誌PLoS ONE上。
為了產生最新的數據資料,研究者將6個小鼠大腦切割分為許多5微米的部分,並且將每一部分分為3個解剖平麵,研究者將這些樣品進行收集並且使用微陣列技術將其分為1毫米厚度的組織碎片,隨後,研究者用36,000個RNA探針對61個組織碎片進行處理並且重建數據以產生貫穿整個小鼠大腦的基因表達3D圖譜。
這種轉錄組斷層技術是一種半自動基礎,相比當前手動方法更為有效和快速,這種技術可以被用於進行任何類型生化分子的組織分布圖譜的繪製,比如蛋白質、脂質、糖類以及microRNAs在組織中的分布圖譜的繪製等。
研究者Okamura-Oho和其同事通過比較以前方法所獲得的數據和現在所獲得的數據,更加確定了這項新型技術,同時研究者也分析了亨廷頓疾病基因表達的樣式,亨廷頓疾病是一種神經變性疾病,主要表現為基底神經節神經元的死亡,緊接著會引發患者大腦皮層細胞的死亡。
研究分析揭示了亨廷丁在大腦區域中處於高表達的水平,這樣就會嚴重影響患者的狀況,比如基底神經節,但是在亨廷丁較低水平的區域,影響就相對小些,比如在中腦和小腦區域。研究者表示,相比MRI,這種新技術可以使得表達圖譜分辨率高達20倍以上,高分辨率的基因表達圖譜就能夠更加詳細地揭示疾病相關的異常情況。
轉錄組斷層掃描數據組可以被上傳至Waxholm空間,這樣就方便研究者們進行資源數據共享以及疾病研究相關的分析。
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