您好!歡迎來到武漢xrk向日葵app生物科技有限公司的官方網站!

表觀組學技術服務

新聞分類

產品分類

聯係xrk向日葵视频app下污

武漢xrk向日葵app生物科技有限公司

電話:027-87606602(市場部)  

          027-62431231(行政部)

Q Q : 270105245   465436937   

         1511879086   812115916

傳真:027-87606602

郵箱:support@celebsonice.com

地址:武漢市東湖高新區高新大道888號高農生物園高農國際1棟  

網址:www.celebsonice.com


【一區4.611分】褐飛虱-xrktw向日葵下载ChIP-seq又發文章

您的當前位置: 首 頁 >> 新聞中心 >> 公司新聞

【一區4.611分】褐飛虱-xrk向日葵appChIP-seq又發文章

發布日期:2020-07-10 作者:xrk向日葵app色板 點擊:

真核生物轉錄起始過程十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與RNA聚合酶Ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程,從而完成對下遊基因的調控作用,那這種調控機製如何去探究的呢?近日Science China-Life Sciences發文FoxO directly regulates the expression of TOR/S6K and vitellogenin to modulate the fecundity of the brown planthopper,闡述了FoxO通過與NlS6K,NlTOR啟動子和NlVg外顯子結合影響Vg網絡中的基因表達來調節昆蟲繁殖力,其中FoxO的ChIP-seq實驗由xrk向日葵app色板承擔。



01-

研究背景


作為保守的轉錄因子,FoxO在抗逆,壽命,生長和繁殖多種生理過程中起著至關重要的作用。人們之前關於FoxO的研究主要集中在人類,小鼠,果蠅和秀麗隱杆線蟲上,而關於農業害蟲的報道很少,特別是關於FoxO如何調節昆蟲繁殖力知之甚少。在亞洲,褐飛虱(BPH)是水稻生產中最嚴重的害蟲之一,高繁殖力是褐飛虱爆發的主要原因。



02-

研究結果


1ChIP-seq鑒定NlFoxO結合位點

為了深入了解NlFoxO如何調節BPH中的繁殖力,作者利用BPH成年和若蟲進行了ChIP-seq,並鑒定了11069個NlFoxO結合的特異peak,這些peak關聯到BPH轉錄組中的2760個基因。基於轉錄組和BPH參考基因組之間的注釋文件,將距5'末端上遊轉錄起始位點3 kb的序列定義為啟動子序列。這些結合區域中,基因間區占61.06%,啟動子占6.80%,內含子占22.56%,基因的CDS占9.18%。在5'或3' UTR檢測到不到0.50%的結合位點。然後作者使用MEME軟件發現四個相似的motif都包含TGTTT core序列。已知FoxO調控的靶基因在不同物種之間差異很大,因此作者比較了BPH,黑腹果蠅和尖音庫蚊的靶基因。結果顯示有18.06%的基因(317)在BPH和果蠅中都是共有的,而在BPH和尖音庫蚊之間沒有發現重疊的基因。果蠅和尖音庫蚊之間隻有3個保守FoxO靶基因。                                         


xrk向日葵视频app下污.png

圖1 FoxO ChIP-seq結果

 

(2)NlFoxO直接與S6K,TOR和Vg結合並影響其表達

作者為了驗證N1FoxO是否特異性結合候選靶基因區域,使用ChIP定量PCR(ChIP-qPCR)進行驗證。ChIP-qPCR結果證實了N1FoxO特異性結合核糖體蛋白S6激酶(S6K),絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶mTOR(TOR),卵黃蛋白原(Vg)這些基因啟動子區域。經過進一步分析發現N1FoxO可能與NlS6K和NlTOR的啟動子以及NlVg的第三個外顯子結合,另外,作者進行了qRT-PCR來驗證NlFoxO對成年雌性這些基因表達的影響。與對照組相比,NlS6K的mRNA水平在72 h內下調,NlTOR的mRNA水平在24 h和48 h下調。相反,NlVg的mRNA水平在所有三個時間點均顯著增加。這些結果表明,N1FoxO的結合可能促進N1S6K和N1TOR的表達,並抑製N1Vg的表達。進一步作者利用螢光素酶活性來檢測啟動子活性。結果表明NlFoxO直接結合增強S6K和TOR的啟動子活性。

xrktw向日葵下载.png

圖2 FoxO ChIP-qpcr驗證


(3)RNAi探究NlFoxO對BPH生殖力的影響

作者以短翅類BPH作為材料,將dsFoxO注射到一天大的BPH短翅類成年雌性,結果發現NlFoxO的mRNA和蛋白水平顯著降低。然後作者進一步評估NlfoxO對BPH繁殖力的影響。結果顯示NlVgR的mRNA水平在72小時內顯著下降。盡管NlVg  mRNA水平在72小時內上調,但注射dsFoxO後72 h N1Vg的蛋白質水平卻顯著降低。最後,作者在注射dsFoxO後去測量BPH雌性所產卵的數量。與對照(dsGFP)相比,每對產卵的平均數量從628.70顯著下降到305.50,下降了51.40%(圖4E),平均孵化率從82.54%顯著下降到75.33%。這些結果證實了N1FoxO對於維持BPH中的正常繁殖是必不可少的。

xrk向日葵app.png

圖3 qRT-PCR驗證NlFoxO對BPH生殖力的影響

 

總的來說,本研究表明FoxO通過與NlS6K,NlTOR啟動子和NlVg外顯子結合影響Vg網絡中的基因表達從而調節昆蟲繁殖力。


本文網址:http://www.celebsonice.com/news/536.html

關鍵詞:轉錄因子,ChIP,xrk向日葵app

最近瀏覽:

聯係xrktw向日葵下载

企業名稱:武漢xrk向日葵app生物科技有限公司

電話:027-87606602(市場部)  027-62431231(行政部)

Q Q :  270105245   1511879086  

          465436937   812115916

傳真:027-87606602

郵箱:support@celebsonice.com

地址:武漢市東湖高新區高新大道888號高農生物

          園高農國際1棟  

網址:www.celebsonice.com


表觀組學技術服務

熱推產品  |  主營區域: 江蘇 天津 武漢 上海 北京 湖北
  • 在線客服
  • 聯係電話

    027-87606602

  • 在線留言
  • 官方微信
  • 在線谘詢
    歡迎給xrk向日葵app留言
    請在此輸入留言內容,xrk向日葵app會盡快與您聯係。
    姓名
    聯係人
    電話
    座機/手機號碼
    郵箱
    郵箱
    地址
    地址