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近些年,單細胞測序技術發展迅猛。好的技術給科研帶來了更為豐富、精準的數據,毫無疑問單細胞技術登上了生命科學的熱搜榜。
2018年單細胞技術被Science評選為10大科學突破之一。2019年單細胞組學技術入選Nature年度技術。單細胞測序技術(single cell sequencing)是指在單個細胞水平上,對基因組、轉錄組、表觀組進行高通量測序分析的一項新技術,它能夠彌補傳統高通量測序的局限性,揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態,反映細胞間的異質性。
技術原理:
10X Genomics 單細胞測序的技術核心利用「微流控芯片」對細胞進行精確區分,通過「10x Barcodes」標記每一個細胞,能實現大規模的單細胞轉錄組測序,從而更高分辨率地揭示宏觀上細胞間細胞種類的區別及每種種類的量的區別、微觀上每個細胞內部的基因表達量上的區別以及其在微環境中的功能情況,在細胞異質性研究中表現出色。
利用10x Genomics 單細胞測序設計:
細胞數量是單細胞測序的首要考量因素,經費充足的情況下,樣本數量越多,文章的分數也相對有所提高。樣本盡可能取的多且盡可能複雜,就不會出現雷同課題。
是否需要生物學重複?
以單細胞轉錄組測序為例,生物學重複是好的,但也並不是必須的。需要綜合考慮研究項目、樣本類型和總細胞量。一般分為以下幾種情況:
1、每個細胞代表了一個生物學重複;
2、不同樣本解釋了特定生物學過程的差異,生物學重複很重要;
3、一個樣本的多個重複來增加研究中的細胞總數;
4、混合不同樣本中的細胞以覆蓋所研究細胞群體。
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