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ChIP

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ChIP

  • 所屬分類:表觀組學技術

  • 點擊次數:
  • 發布日期:2018/11/20
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詳細介紹

真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在。因此,研究蛋白質與DNA在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機製的基本途徑。染色質免疫共沉澱技術(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是目前唯一研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。

 

技術原理

它的基本原理是在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA複合物,並將其隨機切斷為一定長度範圍內的染色質小片段,然後通過免疫學方法沉澱此複合體,特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。ChIP不僅可以檢測體內反式因子與DNA的動態作用,還可以用來研究各種組蛋白共價修飾與基因表達的關係。

 

技術流程

表觀組學技術服務 

 

技術應用

Ø 被特定靶蛋白占據的DNA序列

Ø 在指定的細胞條件下,特定蛋白質(如轉錄因子)在整個基因組上的結合位點和分布

Ø 基因轉錄和聚合酶活性

Ø 與疾病表型相關的複雜的DNA/蛋白質相互作用

Ø 蛋白質(如組蛋白)的修飾,這可能影響染色質結構和基因表達

Ø 核小體結構和染色體維持的調控

Ø 等位基因的特異性結合檢測

 

樣品要求

l 信息:目的基因、轉錄因子的背景資料;

l 樣本:

1. 植物組織/真菌菌絲,2~5g

2. 動物組織,,0.5~2g

3. 細胞係/細菌菌液,取10^6-10^7個做甲醛交聯

l 抗體:進口IP級別抗體/非商業化標準抗體(需檢測),或者由愛基生物提供;

l 樣品運輸:所有樣本液氮速凍之後,選擇幹冰運輸。建議用滅菌的樣品袋或LoBind 管,parafilm將管口密封好。

 

結果展示

基因表達定量 


本文網址:http://www.celebsonice.com/product/572.html

關鍵詞:表觀組學技術服務,基因表達定量,基因表達調控

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