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MeDIP-Seq

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MeDIP-Seq

  • 所屬分類:表觀組學技術

  • 點擊次數:
  • 發布日期:2018/11/20
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詳細介紹

DNA甲基化是表觀遺傳學的熱點研究領域,在調控基因轉錄、傳遞基因組印記、維持染色質結構、調控胚胎發育以及腫瘤等疾病發生中發揮關鍵作用。甲基化DNA免疫共沉澱測序(MeDIP-Seq)作為全基因組DNA甲基化測定的方法有其獨特的優勢。

 

技術原理

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即采用甲基化DNA免疫共沉澱技術,通過5'-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段,然後通過高通量測序可以以較小的數據量,快速高效地尋找基因組上的甲基化區域,從而比較不同細胞、組織、不同樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異。

 

技術流程

表觀組學技術服務 

 

分析流程

基因表達定量 

 

樣品要求

gDNA≥25ug;濃度≥50ng/ul且≥20ul;條帶完整,無降解,無雜質汙染

 

案例分享

兩個擬南芥品種Col- gl和Ler各自的胚和胚乳為材料,利用MeDIP-seq的技術對全基因組的甲基化譜進行研究,研究發現伴隨著胚乳的發育以及胚乳特異的一些基因的表達發生了大規模甲基化的變化。

基因表達調控 

 

參考文獻:

Gehring, M., Bubb, K. L., & Henikoff, S. (2009). Extensive demethylation of repetitive elements during seed development underlies gene imprinting. Science, 324(5933), 1447-1451. doi: 10.1126/science.1171609.


本文網址:http://www.celebsonice.com/product/576.html

關鍵詞:表觀組學技術服務,基因表達定量,基因表達調控

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