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DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現,是表觀遺傳學的重要內容。DNA甲基化過程會使甲基添加到DNA分子上,例如在胞嘧啶環的5'碳上:這種5'方向的DNA甲基化方式可見於所有脊椎動物。WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing)被視為DNA甲基化檢測的“金標準”。
技術原理
其原理是用Bisulfite轉化,將基因組中未發生甲基化的C堿基轉換成U,進行PCR擴增後變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區分開來,再結合高通量測序技術,與參考序列比對,即可判斷CpG/CHG/CHH位點是否發生甲基化,特別適用於繪製單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。
技術流程
分析流程
樣品要求
l DNA:≥2μg(qubit)
l OD260/280為1.8-2.0
案例分享
通過對268例CLL患者的正常B細胞與惡性B細胞,xrk向日葵app發現腫瘤主要來源於正常發育階段反映的成熟狀態的連續性。確定了潛在的致病作用的轉錄因子在CLL中的作用。
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