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瓊中黎族苗族自治縣CUT&Tag

瓊中黎族苗族自治縣CUT&Tag

  • 所屬分類:瓊中黎族苗族自治縣表觀組學技術

  • 點擊次數:
  • 發布日期:2020/09/09
  • 在線詢價
詳細介紹

CUT&Tag是蛋白-DNA互作的一大革新技術,它不需要使用甲醛交聯以及免疫共沉澱,而是通過針對靶蛋白(如轉錄因子、染色質重塑蛋白)的抗體和Protein A的介導,使得與Protein A融合的Tn5酶(Tagmentase)在切割DNA片段的同時在序列兩端加上測序接頭,經PCR擴增後形成可以直接用於高通量測序的文庫.


技術原理:

在抗體引導下,ChiTag酶僅在目的組蛋白修飾標誌、轉錄因子或染色質調控蛋白結合染色質的局部進行目的DNA的片段化,同時添加測序接頭,並釋放到細胞外。由於絕大部分無關的染色質還留在細胞核內,因此整個實驗的信噪比大幅提高,同時簡化了實驗步驟。

cut tag

技術流程:

cut tag


CUT&Tag與ChIP-seq的比較:

cut tag


對於測序後分析的結果,CUT&Tag也能與ChIP-seq一樣得到相似的峰,並且背景更低,信噪比更好:

cut tag

參考文獻:Hatice S. Kaya-Okur, Steven J. Wu, Christine A. Codomo, Erica S. Pledger, Terri D. Bryson, Jorja G. Henikoff, Kami Ahmad & Steven Henikoff. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature communications. 2019, 10(1):1930.


本文網址:http://www.celebsonice.com/product/585.html

關鍵詞:轉錄因子,ChIP-seq,組蛋白修飾

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