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雙鴨山Small RNA-seq

雙鴨山Small RNA-seq

  • 所屬分類:雙鴨山高通量轉錄調控技術

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  • 發布日期:2018/11/20
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詳細介紹

小RNA主要包含miRNA 、piRNA 、siRNA、snoRNA等RNA分子。小RNA參與基因表達與調控、RNA的加工與剪切、蛋白質翻譯、遺傳“入侵”抑製、配子發生等重要生物學過程,是生命活動中必不可少的調控因子。小RNA中主要組成的是微小RNA(microRNA, 簡稱miRNA),可通過識別靶mRNA 實現轉錄後的基因調控。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫係統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。

 

技術原理

小RNA測序通過將18-30 nt範圍的小RNA從總RNA中分離出來,兩端分別加上特定接頭後體外反轉錄做成cDNA再做進一步處理後,利用測序儀對DNA片段進行單向末端直接測序。通過對小RNA大規模測序分析,可以從中獲得物種全基因組水平的小RNA表達信息。

 

技術流程

基因表達定量 

 

分析流程

小RNA 

 

樣品要求

總RNA≥1.5ug;RNA樣品濃度≥250 ng/ul;

 

測序平台策略

BGI平台;SE50

 

案例分享

研究利用高通量測序手段研究了CMA(牛奶過敏)中起關鍵調節作用的 miRNA及其靶基因,為CMA發病診斷和治療策略提供了新思路。研究者選取了4-18個月的兒童中獲得的外周血單核細胞:10例CMA患者和11例健康對照者,構建了smallRNA測序文庫。miR-193a-5p可能在IgE介導的CMA中起作用。這個miRNA可能成為兒童時期食物過敏常見形式的一種新的診斷和治療靶點。


 

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基因表達調控



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關鍵詞:基因表達定量,表觀組學技術服務,基因表達調控

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